殼寡糖本身是一個帶有氨基的生物多糖，含有豐富的C、N元素, 可被微生物分解利用并作為植物生長的養份。
殼寡糖可改變土壤微生物區系, 促進有益微生物的生長，并抑制一些植物病原菌和殺滅線蟲及線蟲卵。
殼寡糖可刺激植物生長，使農作物和水果蔬菜增產豐收。殼寡糖可誘導植物的抗病性, 對多種真菌、細菌和病毒產生免疫和殺滅作用，對小麥花葉病、棉花黃萎病、水稻稻瘟病、番茄晚疫病等病害具有良好的防治作用。
殼寡糖在農業上應用具有微量(PPM級)、高效、低成本、無公害等特點，對我國農業可持續性發展具有重要意義。
農業專用殼寡糖溶液，作為葉面肥以及生物農藥已經在我國進行了大面積的推廣應用，取得了良好的效果。