報告指出，功能性低聚糖與菊粉，膳食纖維和糖醇一起作為益生元最重要的組成部分，自從1996年保齡寶生物股份有限公司大量生產功能性低聚異麥芽糖產品以來，中國功能性低聚糖市場取得了迅猛的發展，在生產成本方面具有較大的優勢，但相對于美國、日本、歐洲市場，中國的功能性低聚糖行業仍處在初級階段。 由于在高附加值產品生產以及售后服務方面的不足，中國低聚糖行業仍然處于全球產業價值鏈的低端。
報告統計數據顯示，目前中國是全球主要的功能性低聚糖生產基地和新興的消費市場，2008年中國功能性低聚糖生產占到全球總量的30%左右。目前中國大約有70個功能性低聚糖制造商， 2010年行業總產能達到30萬噸左右，行業總產量只有大約12萬噸，行業銷售額達到3.5億美金。低聚異麥芽糖，低聚果糖，低聚木糖，大豆低聚糖，低聚麥芽糖是中國主要功能性低聚糖產品，它們2010年總產量超過了11萬噸。中國大部分功能性低聚糖產品采用酶法生產，僅僅少數的功能性低聚糖制造采用提取法。
報告研究表明，由于功能性低聚糖生產原材料之間的差異，中國大部分功能性低聚糖制造商最多能生產1到2種功能性低聚糖。大多數的功能性低聚糖生產商集中分布在原材料豐富的地區，如山東、山西、江蘇、浙江和廣東。目前中國功能性低聚糖行業呈現行業整合的態勢，少數行業龍頭企業市場占有率不斷提高，保齡寶生物股份有限公司、江門量子高科生物有限公司，山東龍力生物科技股份有限公司等是中國功能性低聚糖行業的領軍企業。
得益于明顯的益生功能，功能性低聚糖在中國的應用得到了快速的發展，應用領域涉及乳制品，保健品，食品，飼料，飲料等行業。糖醇，蔗糖，菊粉是功能性低聚糖主要的競爭性產品，彼此在不同下游消費領域優劣勢并存。
西美信息研究員謝淼波表示：由于市場需求的蓬勃發展，中國功能性低聚糖行業將能吸引更多投資者的目光。另外中國低聚糖行業整合步伐將加快，龍頭企業將加快產業鏈整合和提升高附加值功能性低聚糖增加。同時建議投資者理性面對人民幣升值，新勞動法實施，全球經濟危機引起的生產成本上漲帶來的投資風險。
